Characterization of the genetic variability among Caesalpinia pulcherrima (L.) Sw. (Fabaceae) plants using RAPD molecular markers

O flamboyanzinho (Caesalpinia pulcherrima, Fabaceae) é muito utilizado como cerca-viva e na arborização de ruas, parques e jardins. de florescimento exuberante, suas flores podem apresentar coloração rosa, laranja ou amarela, conforme a variedade. Como características florais são essenciais para a definição do valor comercial de espécies ornamentais, o objetivo principal do trabalho foi verificar a existência de polimorfismo entre plantas de C. pulcherrima, que produzem flores de diferentes colorações, por marcadores moleculares RAPD. Foram escolhidas aleatoriamente 30 plantas adultas, cultivadas no município de Jaboticabal, Estado de São Paulo, para a retirada de amostras foliares para a extração de DNA. Dentre essas matrizes, 20 possuem flores alaranjadas, oito, flores amarelas, e apenas duas produzem flores de coloração rosa. Dos 140 primers de RAPD avaliados, 94 foram capazes de ampliar fragmentos definidos, gerando 246 bandas, das quais se observou 100% de bandas monomórficas, indicando que nenhum dos primers utilizados detectou polimorfismo entre os tratamentos. Concluiu-se que a técnica para detecção de polimorfismo por marcadores RAPD não foi eficiente, e que existe a necessidade de se testarem marcadores moleculares mais específicos. Além disso, a característica morfológica cor de flor é, possivelmente, controlada por vários genes ou pela combinação deles.

Genetic variability among the wild boars (Sus scrofa scrofa), crossbred animals and pigs using microsatellite markers (STRs)

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Genetic variability of residual variance of production traits in Nellore beef cattle

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

RAPD analysis of genetic variability in a multiprovenance base population of Eucalyptus grandis hill ex maiden

Este estudo visou avaliar a variabilidade e distância genética dentro de uma população-base de melhoramento genético de Eucalyptus grandis. A avaliação da variabilidade genética tem como objetivos principais analisar a base genética da população-base e montar um banco de dados marcadores moleculares da população em análise. Essa população é formada por 327 indivíduos, principalmente das procedências de Coff's Harbour, Atherton e Rio Claro. Devido à heterozigosidade natural dessa população, ela pode ser dividida em diversas subpopulações, de acordo com a latitude e longitude de origem; e dentro de subpopulações, em função do grau de melhoramento genético já realizado do material analisado no Brasil. Isso permitiu avaliar quanto da variabilidade detectada dentro da população-base foi devido a esses fatores: procedência e grau de melhoramento. A aplicação da técnica RAPD permitiu avaliar 70 locos polimórficos, que foram analisados utilizando-se o coeficiente de Jaccard, o que resultou em matrizes de similaridade genética entre os indivíduos. Os dados de similaridade genética posteriormente foram submetidos à análise estatística. Osdados indicaram que a população-base apresenta ampla base genética, com média de similaridade genética de 0,328. O subgrupo denominado Região 3, composto por material selvagem da macrorregião de Atherton, juntamente com material de APS da macrorregião de Coff's Harbour, foi um dos que mais contribuíram para a ampla base genética da população-base. Foi possível detectar diferença estatística entre as populações selvagens das procedências de Atherton e Coff's Harbour, assim como entre essas procedências e a de Rio Claro.

Biomphalaria tenagophila: genetic variability within intermediate snail hosts susceptible and resistant to Schistosoma mansoni infection

DNA analysis by molecular techniques has significantly expanded the perspectives of the study and understanding of genetic variability in molluscs that ere vectors of schistosomiasis. In tire present study, the genetic variability of susceptible and resistant B. tenagophila strains to S. mansoni infection was investigated using amplification of their genomic DNA by RAPD-PCR. The products were analyzed by PAGE and stained with silver. The results showed pdymorphism between tested strains with four different primers. We found two bonds of 1,900 and 3,420 bp that were characteristic of the susceptible strains with primer 2. The primers 9 end 10 identified a single polymorphic bond that was also characteristic of (3,136 and 5,041 bp, respectively) susceptible snails. Two polymorphic bonds were detected by primer 15: one with 1 800 bp was characteristic of the resistant strain and the other with 1,700 do in the susceptible one. These results provide additional evidence showing that the RAPD-PCR technique is adequate for the study of polymorphisms in intermediate hosts snails of S. mansoni. The obtained results are expected to expend the knowledge about the genetic variability of the snails and to permit the future identification of genomic sequences specifically related to the resistance/susceptibility of Biompholario to the larval forms of S. mansoni.

Genetic variability in Mediterranean buffalos evaluated by pedigree analysis

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Genetic variability of Herpailurus yagouaroundi, Puma concolor and Panthera onca (Mammalia, Felidae) studied using Felis catus microsatellites

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Genetic variability of two populations of Pseudoplatystoma reticulatum from the Upper Paraguay River Basin

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Genetic variability in geographical populations of Aedes aegypti (Diptera, Culicidae) in Brazil elucidated by molecular markers

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Genetic variability of porcine parvovirus isolates revealed by analysis of partial sequences of the structural coding gene VP2

The 3'-terminal 853 nt (and the putative 283 aa) sequence of the VP2-encoding gene from 29 field strains of porcine parvovirus (PPV) were determined and compared both to each other and with other published sequences. Sequences were examined using maximum-parsimony and statistical analyses for nucleotide diversity and sequence variability. Among the nucleotide sequences of the PPV field strains, 26 polymorphic sites were encountered; 22 polymorphic sites were detected in the putative amino acid sequence. Mapping polymorphic sites of protein data onto the three-dimensional (3D) structure of PPV VP2 revealed that almost all substitutions were located on the external surface of the viral capsid. Mapping amino acid substitutions to the alignment between PPV VP2 sequences and the 3D structure of canine parvovirus (CPV) capsid, many PPV substitutions were observed to map to regions of recognized antigenicity and/or to contain phenotypically important residues for CPV and other parvoviruses. In spite of the high sequence similarity, genetic analysis has shown the existence of at least two virus lineages among the samples. In conclusion, these results highlight the need for close surveillance on PPV genetic drift, with an assessment of its potential ability to modify the antigenic make-up of the virus.

Genetic variability analysis among clinical Candida spp. isolates using random amplified polymorphic DNA

The patterns of genetic variation of samples of Candida spp. isolated from patients infected with human immunodeficiency virus in Vitória, state of Espírito Santo, Brazil, were examined. Thirty-seven strains were isolated from different anatomical sites obtained from different infection episodes of 11 patients infected with the human immunodeficiency virus (HIV). These samples were subjected to randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis using 9 different primers. Reproducible and complex DNA banding patterns were obtained. The experiments indicated evidence of dynamic process of yeast colonization in HIV-infected patients, and also that certain primers are efficient in the identification of species of the Candida genus. Thus, we conclude that RAPD analysis may be useful in providing genotypic characters for Candida species typing in epidemiological investigations, and also for the rapid identification of pathogenic fungi.

Implications of genetic variability of Trypanosoma cruzi for the pathogenesis of Chagas disease

O Trypanosoma cruzi, agente etiológico da doença de Chagas, apresenta elevado grau de variabilidade genética intra-específica, com possíveis implicações na forma clínica da doença, como o desenvolvimento de cardiopatia, do megaesôfago e do megacólon de forma isolada ou em associação. Este tropismo tecidual envolvido na patogênese da doença não está totalmente esclarecido. Assim, nesta revisão são abordados alguns aspectos referentes à diversidade genética dos parasitas isolados, às formas clínicas da doença de Chagas, ao processo de infecção do parasita na célula hospedeira e resposta imune. Outros aspectos também são enfocados, como os fatores imunossupressivos liberados pelo parasita que atuam na regulação das respostas imunes, a inibição da apoptose da célula hospedeira, assim como da patogênese do megaesôfago chagásico que pode estar relacionada à interação hospedeiro- parasita e sua associação com risco aumentado para o desenvolvimento do carcinoma epidermóide do esôfago. Porém, apesar dos avanços no entendimento desta doença, ainda não é possível estabelecer o verdadeiro perfil da variabilidade genética do parasita com a forma clínica da doença de Chagas.

Morphological characterization and reproductive aspects in genetic variability studies of forage peanut

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Genetic variability in natural populations of Zeyheria montana mart. from the Brazilian Cerrado

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)